Seriál o STELLARIS systémech - 3. díl: Detekce a TauSENSE technologie
Seriál o STELLARIS systémech - 3. díl: Detektory v detailu a STELLARIS TauSENSE technologie
V minulém díle jsme pojednávali o AOBS a použití různých laserů v systému STELLARIS. V předchozích dílech jsme představili nové detektory, ale nezabývali jsme se principem a průřezem různých technologií pro detektory. V tomto díle se budeme těmto technologiím věnovat a představíme si novinku Leica STELLARIS TauSENSE v podobě tauGating, tauContrast a tauSeparation.
Není detektor jako detektor
Začneme u nejjednoduššího a nejznámější typ detektoru používaného u běžných konvenčních konfokálních systémů je PMT (Photomultiplier Tubes) viz obr.1. Je znám již od počátku 30. let [1]. Je založen na fotoelektrickém jevu, který poprvé popsal H. Hertz [2] a interpretoval A. Einstein [3]. Fotokatoda je obvykle vrstva alkalických atomů, která uvolní elektrony po absorpci fotonů na tuto vrstu. Fotokatoda je obvykle vystavena záření fotonů, které se detekují jako signal. Účinnost takových fotokatod je okolo 30% QE (kvantová účinnost = kolik fotonů dopadne v poměru generovaných elektronů). Přiložené napětí umožňuje zrychlit fotoelektron na první dynodu, kde se uvolňují sekundární elektrony. Zisk na dynodách je obvykle omezen na méně než pětinásobek, kvůli vlastnostem materiálu dynod. Elektrický impuls generovaný jedinou dynodou nelze odlišit od elektrického šumu. Aby se dosáhlo dostatečného zisku, jsou sekundární elektrony urychlovány na další dynodu atd. [4]. Slabé signály s vyšším gain (vyšší napětí pro urychlení) jsou s velkým šumem na pozadí.
Obr. 1 - Trubice fotonásobiče (PMT): Foton (hν) zasáhne fotokatodu, kde se uvolní fotoelektron (e-). Počet elektronů (modré tečky) se vynásobí na každé dynodě a konečný elektronový mrak se odečte na anodě.
GaAsP (PMT) detektor už není to nejlepší
Díky vývoji materiálů lze poměr QE zlepšit použitím katody pro PMT detektor s vrstvou galium arsenid (GaAsP) až na QE okolo 45%, což přinese zlepšení při slabších signálech. Co ale onen zmiňovaný šum pro takový typ detektoru? Správně si odpovídáte ano, nic se nemění, čím více zvyšujete gain, tím více šumu generujete. Často si klademe, jakou vlastně hodnotu gain nastavit, jak kvantifikovat apod. Jak toto vyřešit?
Lavinová fotodioda APD (Avalanche Photodiodes) přináší velké zlepšení z pohledu šumu. Upravená PIN dioda, doplněná multiplikační vrstvou obr. 02. Pokud je foton absorbován ve vnitřní vrstvě, vygeneruje nábojový pár (vnitřní fotoelektrický efekt), náboj je poté zrychlen aplikovaným napětím. Silné elektrické pole v multiplikační zóně (p-n, na obr. 02) způsobuje zesílení uvolněním mnoha (až přibližně 1000) dalších nábojů. Výstupní signál je úměrný počtu absorbovaných fotonů, proto lze zařízení v určitém rozsahu intenzity použít jako světelný senzor.
Obr. 2 - Lavinová fotodioda (APD): absorpce fotonu ve vnitřní (i) zóně způsobí oddělení náboje, náboj je dale distribuován do multiplikační zóny (pn), kde se dosahuje vyšších zisků.
GaAsP vrstva a APD = Leica Power HyD
Hlavním omezením PMT je nízký zisk v každém kroku násobení a generování šumu. Hlavním omezením APD je rozsah činnosti: pouze velmi nízké intenzity. Hybridní kombinace obou technologií nabízí řešení, které naštěstí ukazuje výhody obou. Tato kombinace vakuové a polovodičové technologie byla původně vyvinuta pro experimenty ve fyzice částic [5]. Leica Microsystems vyvinula tento nový typ detektoru pro systémy. Princip je zobrazen na obr. 3, kdy se generuje signál na vysoce citlivé vrstvě GaAsP či SiliconBased a vyráží se elektrony, které jsou urychlené na část APD detektoru. Obrovská výhoda je minimalizaci výsledného šumu a rychlosti detekce jednotlivých příchozích fotonů. Neunikne Vám už jediný foton!
Obr. 3. Princip HyD detektoru a srovnání rychlosti detekce jednotlivých signálů
Nová řada Power HyD S, X, R detektory
Další velmi důležitým parametrem je zisk signálu pro jednotlivé detektory v celé spektrální oblasti, resp. kde je jaký detektor vhodné použít. U nové řady detektorů Leica Power HyD S je tento rozsah opravdu obrovský. Celé spektrum pro použití je zobrazeno na obr. 4. Další HyD X a HyD R je dedikovaný pro FLIM, FCS, FLIM-FRET experimenty se systémem STELLARIS8 FALCON. Poslední z řady Power HyD R je s vyšším ziskem v červené oblasti. Všechny detektory jsou přizpůsobené pro snímání až do oblasti do 850nm! Jaký vybrat? HyD S je opravdu dobrá volba pro rutinní snímání, HyD X a HyD R jsou doporučené pro FLIM, FCS experimenty a HyD R navíc až do 850nm.
Obr. 4. Spektrální rozsah jednotlivých detektorů
Další vlastností tohoto detektoru je možnost přepnutí z analogového modu do digitálního pro velmi silné signály, použití pro reflexi apod. viz obr. 5.
Obr. 5. Ukázka různých modu pro Power HyD S detektor
Nová technologie STELLARIS TauSense
Do současnosti většina systémů měřila pouze intenzitu fluorescence. Nová technologie s názvem STELLARIS TauSENSE Vám dává potenciál přidat novou informaci, nejenom o intenzitě, ale především době příchodu fotonu (lifetime). Informaci o době života zpracovává do metadat ke každému snímku. Vhodné to je především proto, kdy jsi nejste jistí cross-talkem, autofluorescencí, artefaktům apod. Ve zkratce tato technologie odkryje všechny nepřesnosti, které můžou při snímání nastat. STELLARIS TauSENSE obsahuje několik možností separace jako například TauContrast, TauGating, TauScan a TauSeparation, které si rozebereme.
Začneme s první zmíněnou technologií TauContrast. Kontrast je detekován pro každý pixel průměrnou dobou příchodu (AAT) fotonů detekovaných během doby prodlevy pixelu (pixel dwell time). Snímky ukazují savčí buňku značenou téměř infračervenou membránovou barvou. Šipky označují vezikuly s různými hodnotami pH (červená, modrá, zelená). Na obr. 6 je obrázek intenzity: bodové vezikuly vykazují vyšší intenzitu než okolní cytoplazma. Obrázek TauContrast: s tabulkou (LUT) barevné překrytí odpovídá AAT (0-1 ns); změny vezikulárního pH během internalizace jsou patrnější než na obrázku intenzity, s měřítkem 20 μm.
Obr. 6. STELLARIS TauSENSE a jednotlivé módy TauContrast
Díky této metodě získáte přístup k fyziologickým informacím s parametry, jako jsou změny pH, teploty a koncentrace iontů. Kromě zachycení informací o intenzitě fluorescence pro každý pixel obsahuje podrobnosti o průměrných dobách příchodu fotonu (lifetime), která se může měnit v závislosti na posunech v mikroprostředí. Pomocí TauContrast lze takové změny mapovat a vizualizovat. Například rozdíly v hodnotách pH, intracelulární vezikuly nejsou podle intenzity fluorescence patrné. S TauContrast jsou tyto rozdíly odhaleny, protože lifetime jednotlivých fluoroforů se liší v závislosti na lokálním pH.
Další možností je a technologií je TauGating, který lze použít k odstranění nežádoucího signálu opět na základě liftime jednotlivých fotonů. Například snímky intenzity bazální membrány v živých buňkách často obsahují reflexi, která může maskovat důležitý signál. Odražené fotony mají kratší lifetime ve srovnání s fluorescenčním signálem a proto lze rozlišit a odseparovat signály pomocí funkce TauGating. Na obr. 7 je uveden příklad pro TauGating, který oddělue nežádoucí signál od endogenního pigmentu (purpurová, krátké ATs) spočítáním fotonů přicházejících během vybraného časového úseku. Získáme tak čistý sledovaný signál (azurová, dlouhá ATs) Stupnice: 200 μm. (Ukázka obrázku se svolením: Julien Vermot, IGBMC, Štrasburk). Vzorek zebrafish z řady 4xGTIIC: d2GFP, která stále obsahuje jejich nativní pigmenty. Signál GFP poskytuje odečet aktivity Yap1 / Taz-Tead a zde se používá k vizualizaci pruhového svalu trupu.
Obr. 7 - STELLARIS TauGating
Poslední novou technologií jsou TauScan a TauSeparation, využívájí lifetime pro oddělení fluoroforů, které nelze spektrálně oddělit pomocí zmíněných dvou předchozích technologií. Využitím rozdílů v časech příchodu jednotlivých fotonů a signálů od LifeAct-GFP a MitoTracker Green (purpurová) lze jasně oddělit jednotlivé fluorofory, přestože se výrazně spektrálně překrývají. Tato technologie významně rozšiřuje potenciální počet a kombinace fluoroforů, které lze použít v jednom experimentu. Na obr. 8 je uveden TauScan a TauSeparation. TauScan a TauSeparation buněk savců exprimujících LifeAct-GFP (vyráběný společností ibidi GmbH) a označené zelenou mitochondriální skvrnou. Schéma ukazuje distribuci komponent po celou dobu životnosti s měřítkem 10 μm. Také jsou vidět časové vyhodnocení doby života (lifetime) v kombinaci s počtem fotonů.
Obr. 8 - STELLARIS TauScan a TauSeparation
STELLARIS Vám otevírá nové možnosti
STELLARIS přináší nový rozměr pro konfokální mikroskopii a poskytuje výrazně víc informací než současné konvenční konfokální systémy. S kontrasty TauSENSE a pouhými několika kliknutími můžete odstranit nechtěný signál a odhalit více detailů ve svých snímcích, multiplexovat více fluorescenčních barviv v jednom experimentu a oddělit fluorofory, které mají překrývající se spektra. Síla v použití lifetime je obrovská a vy prozkoumáte mnoho lokalizačních i mikroenvironmentálních změn. Klíčové pak je, že STELLARIS shromáždí všechny tyto informace i z jediného detektoru a zbývající detektory nechá volné pro další fluorescenční barviva. Srovnání technologií je pak na obr. 9, kde je znázorněno jak jednoduše lze nadefinovat na 2 detektory až 4 fluorescenční lifetime kanály.
Obr. 9 STELLARIS vs. tradiční konfokální mikroskopy bez lifetime
Co bude v dalším díle?
V dalším díle se zaměříme na rychlost konfokálních systému, jednoduchost použití konfokálních systémů s Image Compas a LAS X Navigator. Na něco jsme zapomněli? Něco není dobře popsané, máte jakýkoliv dotaz, napište nám na mikroskopie@pragolab.cz.
Na něco jsme zapomněli? Něco není správně popsané? Máte jakýkoliv dotaz? Napište nám na: mikroskopie@pragolab.cz
Prohlédněte si i předchozí síly seriálu o STELLARIS systémech:
Seriál o STELLARIS systémech - 1. díl: Detekce
Seriál o STELLARIS systémech - 2. díl: AOBS a Lasery
Reference:
Nenechte si ujít další zajímavosti
- Thermo Scientific Stellar - revoluční hmotnostní spektrometr
- Představujeme: Revoluční platforma iontových chromatografů Thermo Scientific™ Dionex™ Inuvion™ z pohledu aplikací!
- Thermo Scientific Dionex Inuvion – nová úchvatná platforma iontových chromatografů
- UVIDĚT ZNAMENÁ UVĚŘIT – NOVÁ PŘIDANÁ INFORMACE K VÝSLEDKŮM TERMICKÉ A MECHANICKÉ ANALÝZY
- Analýza neutrálních i iontových PFAS v ovzduší pomocí termické desorpce ve spojení s plynovou chromatografií a hmotnostní spektrometrií (TD-GC-MS/MS).